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东京齿科大学和东京医科齿科大学的区别主要有：
1、办学性质不同：东京齿科大学是私立大学，东京医科齿科大学是国立大学。
2、建校时间不同：东京齿科大学建立于1890年，东京医科齿科大学建立于1928年。
3、专业设置不同：东京齿科大学设有牙科基础和临床牙科两个专业，东京医科齿科大学设有医齿学综合研究、医学科、保健卫生学科看护学专攻、保健卫生学科检查技术学专攻、齿学科、口腔保健学科口腔保健卫生学专攻。
材料补充：
东京齿科大学本部位于千叶县美滨区，是日本最老的牙科大学，也是战后没有被破坏的旧制牙科学校的六所学校中的一所。东京医科齿科大学位于日本东京都文京区，该校现拥有3个校区，分别是汤岛校区、骏河台校区和国府台校区，其中汤岛校区为该校主校区，设有医学部、牙医学部、医齿学综合研究科、保健卫生学研究科、附属医院和中央图书馆。
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